截至2010年9月,新疆昌吉卫生学校为社会培养了2万余名毕业生,学校先后荣获全国十佳办学单位、中国校园文化建设百佳示范学校、全国教育网络系统示范单位。《中国教育报》、《人民日报》、《昌吉日报》等媒体多次报道了该校特色办学情况。
2001年新疆昌吉卫生学校被批准为国家级重点中等职业学校,2002年新疆昌吉卫生学校获得新疆维吾尔自治区精神文明单位,2003年国家教育部对国家级重点中专复评中,专家组认为新疆昌吉卫生学校在全疆中等职业学校中具有较强的典型示范作用,2004年新疆昌吉卫生学校成为国家教育部确定的六十五所“全国护理专业技能型紧缺人才示范性培训基地”院校之一。2007年新疆昌吉卫生学校在新疆维吾尔自治区卫生职业学校专业设置评估中取得好成绩,2008年新疆昌吉卫生学校在新疆维吾尔自治区第一批重点中等职业学校人才培养水平评估中取得第一名。2008年、2009年连续两年新疆昌吉卫生学校获得新疆维吾尔自治区护理技能大赛团体一等奖,2009年8月10日新疆昌吉卫生学校获得全国职业院校护理技能操作大赛团体一等奖,2010年新疆昌吉卫生学校获得新疆维吾尔自治区职业院校“医模杯”护理专业(中职组)技能大赛团体一等奖。