我校目前有28个本科专业，其中首批国家级一流专业5个，分别为临床医学（含5年制、“5+3”一体化、免费医学生）、预防医学、法医学、药学、护理学；首批省级一流专业4个，分别为麻醉学、医学影像学、口腔医学、中药学。
办学实力我校是全国首批硕士学位、学士学位、公共卫生硕士专业学位、教育医学学士学位授权单位，是山西省首批博士授权单位、七年制临床医学专业开设单位、临床医学硕士学位试点单位。学校共有生理学、血液内科学、流行病与卫生统计学3个博士点，共有8个学科可招收培养博士生；43个学科具有硕士学位授予权（其中34个学科具有在职硕士学位授予权），是山西省高校硕士学位授予点多的院校之一。我校的生理学科名家荟萃，实力雄厚，是国家重点学科。生理学、生物化学、与分子生物学、血液内科学、儿少卫生与妇幼保健学、心血管内科学、药理学、法医学7个学科为山西省重点学科。学校编辑出版有《山西医科大学学报》、《实用急救医学杂志》、《护理研究》等十余种学术刊物。与美国、日本、意大利、澳大利亚、德国等多个国家的多所高校建立了友好合作关系。学校师资力量雄厚，现有教职工、医护共5000余人，拥有一支博士后、博士、硕士和留学回国人员组成的实力雄厚的教师队伍，现有博士生导师27名，硕士生导师353名，国家级有突出贡献的中青年专家2名，有省级优秀专家20名，有80多人享受政府特殊津贴，有16人被评为省青年学科带头人。数十名专家、教授参加全国规划教材的编写，担任《中国医学百科全书》有关分卷的编委，担任国家级有关学会和专业委员会的理事和常务理事。学校现有各类在校声生16000余人，馆藏图书40余万册，中外期刊1600余种，并与国内900多个单位建立了内部图书资料交换关系，教科研医仪器设备总值近10亿元，为广大师生提供了良好的教学科研条件。
根据国家计划和市场需求我校即使调整专业设置，从2000年开始增设七年制临床医学专业，培养具有硕士水平的高级临床医师。我校是全国早设立卫生系（预防医学专业）的院校之一。80年代曾设的法医学专业，为全国培养了大批高素质的法医人才，毕业生供不应求，连续几年来，就业率高达85%以上。药学、口腔医学、医学影像学和护理学专业的设置为医药领域各个方面储备和培养高级人才，填补了我省乃至全国范围内这些学科没有毕业生的空白。2003年，我校新曾设麻醉学、社会工作、信息管理与信息系统3个专业，进一步增强了医学学科的交叉性和综合性，拓宽了医学人才培养的途径。
为进一步改善办学条件，拓展办学资源，我校拟对本部旧址进行大规模改造，并在小店区太原市高新技术开发区原药铺基地上筹建新校区，力争使学校的基础设施和办学环境更趋于科学合理，为广大有志青年提供良好的就读环境。
新世纪之初，学校顺应经济全球化的潮流和医学教育模式转变的需求，提出了“立足山西、面向全国、四位一体、办出特色”的办学目标，积极创建教学科研型的高等医科大学，努力把学校建设成为山西省医学人才培养的中心、医学科学研究的中心、医疗保健服务的中心和医药产业开发的中心，力争早日跻身于全国同类院校的先进行列。
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