上海海洋大学历经100多年的发展，学科专业有了很大拓展，实现了从单一学科向多学科的转变，形成了以海洋、水产、食品学科为特色的覆盖农、理、工、文、经、管、法等学科大类的本科专业体系。截止2018年设置本科专业43个（含独立设置专业方向）。
学院 | 本科专业名称（英文） | 授予
学士学位 | 学科门类 | 专业代码 | 专业评估 | 备注 | 水产与生命学院 | 生物技术
（Biotechnology） | 理学 | 理学生物科学类 | 071002 | 通过 |
| 生物科学
（Biological Science） | 理学生物科学类 | 071001 | 市级优秀专业 | 国家特色专业 | 生物科学(海洋生物)
（Biological Science(Marine Biology)) | 理学生物科学类 | 071001 | 通过 |
| 水族科学与技术
(Aquarium Science and Technology) | 农学 | 农学水产类 | 090603T | 通过 |
| 水生动物医学
（Aquatic Animal Medicine) | 农学水产类 | 090604TK |
|
| 水产养殖学
（Aquaculture） | 农学水产类 | 090601 | 校级优秀专业 | 国家特色专业、应用型本科试点专业 | 海洋
科学
学院 | 海洋渔业科学与技术
（Marine Fishery Science and Technology） | 农学水产类 | 090602 | 校级优秀专业 | 国家特色专业、应用型本科试点专业 | 海洋技术
（Marine Technology） | 理学 | 理学海洋科学类 | 070702 | 通过 |
| 海洋科学
（Marine Science) | 理学海洋科学类 | 070701 | 通过 |
| 海洋资源与环境
（Marine Resources and Environment） | 理学海洋科学类 | 070703T |
| 2017年增设 | 食品
学院 | 食品科学与工程
（Food Science and Engineering） | 工学 | 工学食品科学与工程类 | 082701 | 校级优秀专业 | 国家特色专业 | 食品质量与安全
（Food Quality and Safety） | 工学食品科学与工程类 | 082702 | 通过 |
| 能源与动力工程
（Energy and Power Engineering) | 工学能源动力类 | 080501 | 通过 |
| 建筑环境与能源应用工程
（Building Environment and Energy Engineering) | 工学土木类 | 081002 | 通过 |
| 包装工程
（Packaging Engineering） | 工学轻工类 | 081702 | 通过 | 应用型本科试点专业 | 生物制药(Biopharmaceuticals | 工学生物工程类 | 083002T |
| 2016年增设 | 海洋环境与生态学院 | 环境科学
（Environmental Science） | 理学 | 工学环境科学与工程类 | 082503 | 通过 |
| 环境工程
（Environmental Engineering） | 工学 | 工学环境科学与工程类 | 082502 | 通过 |
| 园林
（Landscape Architecture) | 农学 | 农学林学类 | 090502 | 通过 | 停招 | 生态学
(Ecolgoy) | 理学 | 理学生物科学类 | 071004 |
| 2018年增设 | 工程
学院 | 机械设计制造及其自动化
（Machine Design & Manufacture and Their Automation） | 工学 | 工学机械类 | 080202 | 校级优秀专业 |
| 电气工程及其自动化
（Electrical Engineering and Automation） | 工学电气类 | 080601 | 校级优秀专业 |
| 物流工程
（Logistics Engineering） | 管理学物流管理与工程类 | 120602 | 通过 |
| 工业工程
（Industrial Engineering） | 管理学工业工程类 | 120701 | 通过 |
| 测控技术与仪器 (Measurement and Control Technology and Instrument) | 工学仪器类 | 080301 |
| 2018年增设 | 信息
学院 | 信息与计算科学
（Information and Computing Science） | 理学 | 理学数学类 | 070102 | 通过 |
| 计算机科学与技术
（Computer Science and Technology） | 工学 | 工学计算机类 | 080901 | 校级优秀专业 |
| 空间信息与数字技术
（Spatial Information and Digital Technology) | 工学计算机类 | 080908T |
|
| 软件工程
(Software Engineering) | 工学 | 工学计算机类 | 080902 |
| 2016年增设 | 经济管理学院 | 金融学
（Finance and Banking） | 经济学 | 经济学金融学类 | 020301k | 通过 |
| 国际经济与贸易
（International Economics & Trade） | 经济学经济与贸易类 | 020401 | 通过 |
| 物流管理
（Logistics Management） | 管理学 | 管理学物流管理与工程类 | 120601 | 通过 | 应用型本科试点专业 | 市场营销
（Marketing） | 管理学工商管理类 | 120202 | 通过 |
| 会计学
（Accounting） | 管理学工商管理类 | 120203k | 校级优秀专业 |
| 农林经济管理
（Economics and Management of Agriculture and Forestry） | 管理学农业经济管理类 | 120301 | 通过 | 国家特色专业 | 工商管理（食品经济管理）
（Business Administration(Economics and Management of Food）) | 管理学工商管理类 | 120201k | 通过 |
| 海洋文化与法律
学院 | 行政管理
（Public Administration） |
| 管理学公共管理类 | 120402 | 整改 |
| 社会工作（Social Work) | 法学 | 法学社会学类 | 030302 | 通过 |
| 外国语
学院 | 英语（English） | 文学 | 文学外国语言文学类 | 050201 | 通过 |
| 日语（Japanese） | 文学外国语言文学类 | 050207 | 通过 |
| 朝鲜语（Korean） | 文学外国语言文学类 | 050209 | 通过 |
| 爱恩
学院 | 信息管理与信息系统（Information Management & Information Systems） | 管理学 | 管理学管理科学与工程类 | 120102 |
| 中外合作项目论证 | 市场营销（国际商务）
(Marketing(International Commerce)) | 管理学工商管理类 | 120202 |
| 中外合作项目论证 |
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