根据物理学科的教学和认知规律，物理学（强基计划）专业的全部课程包括通识教育课程、专业基础课程、专业核心课程、专业选修课程或跨专业选修课程、毕业设计或论文以及任选课程。课程按照教学形式分为理论课程、实验课程以及各类实践和研究体验式课程。
本专业的专业必修课程包括基础课程和专业核心课程：基础课程有数学基础课程（数学分析、线性代数及数值计算与程序设计等）、普通物理系列课程（含实验）、科学研究导论等；专业核心课程主要是分析力学、电动力学、量子力学、热力学与统计物理、专业物理实验、计算物理、数学物理方程、复变函数、概率统计、固体物理和科学研究实践等。
完成上述专业类必修课程后，物理学（强基计划）专业学生可以选择物理学类专业课程，课程设置6个方向的模块化课程：核物理与粒子物理方向、激光等离子体物理方向、凝聚态物理方向、原子分子光科学方向、天体物理方向和应用物理学方向（其中部分课程为本硕博衔接课程）。
学生也可跨专业选修与国家重大战略需求的高端芯片与软件、智能科技、新材料、先进制造和国家安全等关键领域相关的专业类课程。学生作为专业类课程在一个领域修满20学分，满足《上海交通大学本科生辅修专业修读管理办法》的要求，在授予物理学学士学位的同时，可授予相应的辅修工学学位。
学生跨专业选修的领域和课程包括：
（1）高端芯片领域：电路理论、模拟电子技术、数字电子技术、半导体物理、半导体器件原理；
（2）智能科技领域：程序设计思想和方法、数据结构、算法设计与分析、人工智能基础；
（3）新材料领域：材料科学基础、材料性能、材料组织结构的表征。
（4）先进制造领域：计算固体力学与程序设计、计算流体力学与程序设计、复杂系统动力学计算机辅助设计、微纳材料的跨尺度计算、大型航天器在轨组装动力学、海洋环境流体力学；
（5）信息安全领域：离散数学、计算机组成与系统结构、网络空间安全及法律法规、操作系统原理、信息安全综合实践、数据库原理及安全。
2022年上海交通大学物理学（强基计划）专业培养方案本博衔接的办法
2022年上海交通大学物理学（强基计划）专业培养方案阶段性考核和动态进出办法
2022年上海交通大学物理学（强基计划）专业培养方案具有良好的综合素养、职业道德和社会责任感。
2022年上海交通大学物理学（强基计划）专业培养方案培养目标
2022年上海交通大学物理学（强基计划）专业培养方案培养目标及培养要求
2022年上海交通大学物理学（强基计划）专业培养方案教学及科研条件资源平台
2022年上海交通大学物理学（强基计划）专业培养方案师资队伍
2022年上海交通大学物理学（强基计划）专业培养方案专业简介
2022年上海交通大学物理学（强基计划）专业培养方案基本情况
2022年上海交通大学物理学（强基计划）专业培养方案课程设置
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